БАЗА ЭКСПЕРТНЫХ ЗНАНИЙ ОБ АРХИТЕКТУРЕ СИНАПСА.

Новая база данных SynGO облегчит нейробиологам поиск информации о функции и структуре синапсов.

«Мозг — это очень сложная машина, которая находится у нас в черепной коробке» (с). Консорциум SYNGO, объединяющий сеть из 15 лабораторий по всему миру, и Консорциум генной онтологии выпустили SYNGO 1.0 — первую версию базы современных научных знаний об архитектуре синапсов. Об этом в июне 2019 года сообщает межнациональная группа авторов в журнале «Neuron». SYNGO был создан в 2015 году совещанием международных экспертов по синапсам в Центре Стэнли, на котором были рассмотрены возможности формирования консорциума для создания всемирно приемлемого формата описания архитектуры синапсов. SYNGO опирается на предыдущие инициативы, созданные в европейских исследовательских консорциумах по синапсам (EU-Synapse, EuroSpin, SynSys).

Синапс (от греческого соединение, связь) – особое образование: место контакта между двумя нейронами или между нейроном и получающей сигнал эффекторной клеткой, которое служит для передачи нервного импульса между двумя клетками, причём в ходе синаптической передачи амплитуда и частота сигнала могут регулироваться.

Синапсы — фундаментальные единицы обработки информации в головном мозге. Синаптическая дисрегуляция — центральное звено в патогенезе многих заболеваний и нарушений головного мозга («синаптопатиях»). Однако систематизированная аннотация синаптических генов и онтология синаптических процессов до настоящего времени отсутствовали.

Ученые создали SynGO — интерактивную базу знаний, в которой собраны доступные исследования биологии синапсов с использованием аннотаций генной онтологии (Gene Ontology — GO): 87 синаптических локаций и 179 синаптических процессов. Аннотации SynGO основаны исключительно на опубликованных экспертных данных. Используя 2922 аннотации для 1112 генов, исследователи показали, что синаптические гены мало изменились в ходе эволюции и менее устойчивы к мутациям, чем другие гены, связанные с нарушениями развития нервной системы, включая шизофрению.

SynGO — это общедоступный универсальный справочник по исследованиям синапсов и онлайновая аналитическая платформа для интерпретации крупномасштабных данных. «До сих пор отсутствовала база данных с информацией обо всех синаптических белках, которые можно найти кликом мышки», — сообщают ученые из Института нейробиологии Leibniz Institute for Neurobiology (Германия).

«Уникальная особенность базы данных SynGO заключается в том, что она является наиболее полным источником информации о функциях синапсов», — сообщает профессор Gundelfinger ED. Исследователи собрали более 1100 отдельных синаптических белков и их генов и каталогизировали их в соответствии с их свойствами. Десятилетия исследований предоставили описания для различных типов синапсов, а также много подсказок о том, как различные белки работают вместе, чтобы управлять синаптическими функциями. Пользователи найдут информацию о том, где находятся белки внутри синапса и какова их функция. «Таким образом данные о генетических синаптических расстройствах и связанных с ними заболеваниях, называемых синапопатиями, могут быть связаны».

Синапсы — это микроскопические структуры, используемые нервными клетками для передачи информации. «Передача сигналов между нейронами контролируется большим количеством белков, которые играют важную роль по обе стороны синапса и, вероятно, кодируются несколькими тысячами генов», — объясняют специалисты исследовательской группы по нейропластичности. «Различия в синаптических генах связаны, к примеру, с интеллектом, грамотностью, обучаемостью, СДВГ, аутизмом и биполярным расстройством, а также различными расстройствами нервного развития».

Перинейрональные сети мозга — что окружает нейроны? Поиск новых методов лечения эпилепсии — как разрушение перинейрональных сетей приводит к возникновению судорожных припадков, развитию нейродегенеративных заболеваний и когнитивных нарушений? – читайте на сайте Специализированного медицинского центра ЭВО.

Источники: Neuron / SynGO: An Evidence-Based, Expert-Curated Knowledge Base for the Synapse

Cell, SynGO: An Evidence-Based, Expert-Curated Knowledge Base for the Synapse